Sekwencjonowanie DNA w 5 godzin – rekord Guinnessa

Zespół badaczy z Uniwersytetu Stanforda pobił Rekord Guinnessa, opracowując sposób na sekwencjonowanie DNA w 5 godzin i 2 minuty. Wykorzystano do tego sztuczną inteligencję i wsparcie takich organizacji jak Baylor College of Medicine, Google, Nvidia, Oxford Nanopore Technologies i Uniwersytet Kalifornijski w Santa Cruz.

„Myślę, że jesteśmy jednogłośnie zgodni, że jest to po prostu cud. To osiągnięcie, które zapisało się w podręcznikach historii i zainspiruje kolejne pięć i dziesięć lat fantastycznej pracy nad rewolucją biologii cyfrowej, w której genomika przoduje” – powiedziała podczas wydarzenia Kimberly Powell, wiceprezes ds. opieki zdrowotnej w firmie Nvidia.

Sekwencjonowanie DNA w 5 godzin

Badacze z Uniwersytetu Stanforda pod kierownictwem dr Euana Ashleya, a także przy wydatnej pomocy Baylor College of Medicine, Google, Nvidii, Oxford Nanopore Technologies i Uniwersytetu Kalifornijskiego w Santa Cruz, opracowali system pozwalający na sekwencjonowanie DNA w niewiele ponad 5 godzin.

Wyniki badania opublikowano w The New England Journal of Medicine (NEJM).

„Musieliśmy całkowicie przemyśleć i zreorganizować nasze potoki danych i systemy pamięci masowej. To był tylko jeden z tych niesamowitych momentów, w których właściwi ludzie nagle zebrali się, aby osiągnąć coś niesamowitego. Naprawdę czułem się, jakbyśmy zbliżali się do nowej granicy” – powiedział dr Euan Ashley.

Do analizowania ogromnej ilości danych z wysokoprzepustowego sekwencjonowania nanoporów w komórkach PromethION Flow Cells firmy Oxford Nanopore wykorzystano procesory graficzne Nvidia.

Szybkie sekwencjonowanie DNA potwierdzone rekordem Guinnessa

Wynik został potwierdzony przez niezależnego eksperta organizacji Guinness World Record i zakończył się przyznaniem dyplomu całemu zespołowi.

Nieco tylko ponad 5 godzin wystarczy, aby zsekwencjonować DNA. Jest to o 9 godzin szybsza technologia w porównaniu do poprzedniego rekordowego systemu.

Co więcej, dr Euan Ashley twierdzi, że dalsza optymalizacja każdego elementu procesu da możliwość skrócenia tego procesu przynajmniej o połowę. Gdyby to się udało i można by stosować tę metodę w leczeniu klinicznym, pacjenci mogliby zyskiwać właściwą terapię znacznie szybciej, niż miało to miejsce do tej pory.

Źródło: Uniwersytet Stanforda, NEJM, Nvidia, Guinness World Records